Research Article
Molecular Characterization of Chicken Anemia Virus Circulating in Chicken Flocks in Egypt
Table 3
Amino substitution in VP1 sequence of CAV isolates.
| | Isolate | Amino acid positions | | 22 | 48 | 75 | 83 | 97 | 125 | 139 | 141 | 144 | 157 | | Consensus | H | A | V | I | M | I | K | Q | Q | V |
| | Egy-1 CAV/Egypt | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | Egy-2 CAV/Egypt | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | Egy-3 CAV/Egypt | N | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | Egy-4 CAV/Egypt | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | Cux-1 M Germany | · | · | · | · | · | · | · | · | D | · | | Cux-1 N Germany | · | · | · | · | · | · | · | · | D | · | | Del-Ros/USA | · | · | · | · | · | · | · | · | N | · | | ConnB/USA | · | · | · | · | · | · | · | · | E | · | | 26PA/USA | · | · | · | · | · | · | · | · | E | M | | SMSC-1/Malaysia | · | · | I | · | L | · | · | · | · | · | | CIA-1/USA | N | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | A2/Japan | · | · | · | · | · | · | · | E | E | M | | AF448446/China | · | · | | · | · | · | · | · | E | · | | BD-3/Bangladesh | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | NIE/19.04/118/Nigeria | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | Isolate704/Australia | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | ArgA0021-3/Argentina | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | AN-China 23/China | N | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | CMR09-731/Cameroon | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · | | CL37/Chile | · | · | I | · | L | · | Q | · | · | · |
|
|
