A First Insight into the Genetic Diversity and Drug Susceptibility Pattern of Mycobacterium tuberculosis Complex in Zhejiang, China

Table 1

Distribution of spoligotypes shared by Mycobacterium tuberculosis circulating from Zhejiang Province.

SpolDB4 ID	Spoligotype binary description	SIT	Number (%)
Beijing	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	1	642 (68.3)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□■■■	190	15 (1.6)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■	269	2 (0.2)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■□■■■■■■■	621	3 (0.3)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□■■■■■	632	6 (0.6)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■□■■	941	1 (0.1)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■□□■■■	1168	2 (0.2)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□□■■■■	1364	1 (0.1)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■□■	1674	1 (0.1)
H3	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■□■■■	49	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■	50	6 (0.6)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■	183	2 (0.2)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■□□□□■■■■■■■	390	1 (0.1)
H4	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■□■■■	817	1 (0.1)
LAM9	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	42	1 (0.1)
MANU2	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■	54	6 (0.6)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□■■■■■■■■■	1634	1 (0.1)
S	■■■■■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	34	1 (0.1)
T1	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□□□□	51	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	53	53 (5.6)
	■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	154	2 (0.2)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□□□□■■■■■■■	167	1 (0.1)
	■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	205	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■□■	278	1 (0.1)
	■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	285	1 (0.1)
	■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	334	8 (0.9)
	■■■■■■■■■■■■■□□□□■□□□□□■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	379	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	393	2 (0.2)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■□■■■■■	520	2 (0.2)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□□■■	521	9 (1.0)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■□■■	612	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	803	1 (0.1)
	■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	804	1 (0.1)
	■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□□□□	833	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□■■■	888	2 (0.2)
	■■■■■■■■■■■■■□□□■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	913	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	917	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□■■■■■■■□□□□■■■■■■■	1688	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■□□□□■■■■■■■	1626	1 (0.1)
T2	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	52	40 (4.3)
	■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	118	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■□□□□■■■□■■■	515	1 (0.1)
	■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	1265	1 (0.1)
	■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	1302	2 (0.2)
	■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	1332	1 (0.1)
	□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	1613	1 (0.1)
T2-T3	■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	73	3 (0.3)
T3	■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	37	12 (1.3)
	■■■■■■■■■■■■□■□■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	1547	1 (0.1)
T4	■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	40	1 (0.1)
U	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■	232	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■	246	1 (0.1)
	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■■□■■■	1098	1 (0.1)
	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□□□□	1311	2 (0.2)
U (like H)	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□	46	2 (0.2)
Newly found	—		84 (8.9)

Representing spoligotype families annotated in SITVITWEB database.
SIT from SITVITWEB database.