Expression, Prognosis, and Immune Infiltrates Analyses of E2Fs in Human Brain and CNS Cancer

Table 2

Correlation analysis between E2F and relate genes and markers of monocyte, TAM, and macrophages in TIMER.

Description	Gene markers	GBM
		E2F1		E2F2		E2F3		E2F4		E2F5		E2F6		E2F7		E2F8
		cor		cor		cor		cor		cor		cor		cor		cor
Monocyte	CD86	-0.359		-0.328		-0.242		-0.140	0.084	-0.261		-0.312		-0.193	0.016	-0.224
	CD115 (CSF1R)	-0.239		-0.227		-0.097	0.229	-0.006	0.933	-0.349		-0.352		-0.150	0.062	-0.143	0.076
TAM	CCL2	-0.383		-0.415		-0.309		-0.111	0.17	-0.203	0.011	-0.228		-0.170	0.035	-0.167	0.038
	CD68	-0.246		-0.210		-0.097	0.228	0.010	0.901	-0.306		-0.380		-0.180	0.025	-0.164	0.042
	IL10	-0.392		-0.357		-0.289		-0.141	0.081	-0.259		-0.398		-0.326		-0.302
M1 macrophage	INOS (NOS2)	0.006	0.936	-0.082	0.308	-0.106	0.19	0.164	0.042	-0.114	0.159	0.041	0.61	0.129	0.11	0.116	0.153
	IRF5	-0.246		-0.262		-0.149	0.065	0.064	0.429	-0.362		-0.395		-0.084	0.296	-0.134	0.098
	COX2 (PTGS2)	-0.182	0.023	-0.140	0.082	0.064	0.431	0.035	0.661	-0.091	0.259	-0.087	0.279	-0.032	0.691	0.005	0.944
M2 macrophage	CD163	-0.205	0.010	-0.234		-0.126	0.118	-0.070	0.386	-0.192	0.017	-0.243		-0.060	0.458	-0.103	0.203
	VSIG4	-0.389		-0.346		-0.282		-0.156	0.052	-0.249		-0.373		-0.276		-0.332
	MS4A4A	-0.319		-0.295		-0.231		-0.173	0.031	-0.253		-0.313		-0.241		-0.233
Description	Gene markers	LGG
		E2F1		E2F2		E2F3		E2F4		E2F5		E2F6		E2F7		E2F8
		cor		cor		cor		cor		cor		cor		cor		cor
Monocyte	CD86	-0.203		0.228		0.061	0.166	0.185		0.004	0.910	0.074	0.089	-0.004	0.921	0.157
	CD115 (CSF1R)	-0.285		0.209		0.048	0.269	0.114		-0.029	0.510	-0.041	0.343	-0.147		0.055	0.208
TAM	CCL2	-0.19		0.065	0.137	-0.027	0.532	0.096	0.028	-0.057	0.188	-0.004	0.922	0.01	0.818	0.062	0.153
	CD68	-0.124		0.28		0.076	0.084	0.267		0.057	0.192	0.103	0.018	0.098	0.025	0.224
	IL10	-0.152		0.183		0.043	0.321	0.168		0.002	0.954	0.035	0.421	0.049	0.257	0.145
M1 macrophage	INOS (NOS2)	0.197		-0.005	0.905	0.011	0.801	0.012	0.771	-0.059	0.178	0.014	0.738	0.093	0.034	0.073	0.093
	IRF5	-0.117		0.226		0.008	0.842	0.285		-0.076	0.081	0.038	0.386	0.05	0.250	0.183
	COX2 (PTGS2)	0.009	0.830	0.008	0.849	0.077	0.079	-0.038	0.386	-0.109	0.012	-0.072	0.100	0.047	0.286	0.051	0.242
M2 macrophage	CD163	-0.077	0.077	0.224		0.131		0.193		0.023	0.597	0.153		0.142		0.203
	VSIG4	-0.255		0.256		0.098	0.024	0.183		0.041	0.349	0.08	0.067	-0.079	0.072	0.107	0.014
	MS4A4A	-0.157		0.28		0.134		0.193		0.104	0.017	0.145		0.07	0.107	0.212

Cor: value of Spearman’s correlation; TAM: tumor-associated macrophages. ; ; .