Genetic Diversity of Escherichia coli Coharboring mcr-1 and Extended Spectrum Beta-Lactamases from Poultry

Table 3

Sequence types of Escherichia coli isolates harboring ESBL and mcr genes.

Isolate	ST	CC	MIC of antimicrobial agents												ESBL and colistin-resistant determinants
			AK	CN	TOB	CIP	CTX	CAZ	FEP	IMP	MEM	CT	SXT	TGC
CR-Ec1	131	ST131 Cplx	128	32	32	16	16	64	32	0.25	0.25	8	32	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec2	1035	ST131 Cplx	128	128	4	16	32	64	64	0.25	0.25	4	8	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec3	131	ST131 Cplx	256	64	32	32	16	128	16	0.5	0.5	8	32	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec4	131	ST131 Cplx	128	32	32	16	32	64	32	0.25	0.25	8	32	0.25	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec5	1215	ST131 Cplx	8	64	2	16	16	64	64	0.5	0.5	4	0.5	0.5	blaCTX-M-1, mcr-1
CR-Ec6	1035	ST131 Cplx	256	32	2	8	32	64	64	0.25	0.5	4	8	1	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec7	131	ST131 Cplx	256	64	128	16	16	64	64	0.25	0.25	8	16	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec8	1035	ST131 Cplx	128	32	2	32	64	128	64	0.25	0.25	8	8	0.25	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec9	131	ST131 Cplx	256	128	64	64	64	256	128	0.25	0.25	16	32	0.25	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec10	1650	ST131 Cplx	4	32	2	0.25	0.5	1	1	0.25	0.25	4	0.25	0.5	mcr-1
CR-Ec11	1035	ST131 Cplx	64	16	1	8	32	64	64	0.25	0.25	4	8	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec12	1035	ST131 Cplx	128	32	2	16	32	128	128	0.5	0.5	4	8	1	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec13	1035	ST131 Cplx	64	32	1	16	32	64	64	0.5	0.5	4	8	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec14	131	ST131 Cplx	128	32	64	16	32	64	64	0.25	0.5	8	32	0.25	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec15	1215	ST131 Cplx	2	128	1	32	16	64	64	0.25	0.25	8	0.5	0.5	blaCTX-M-1, mcr-1
CR-Ec16	2279	ST131 Cplx	128	64	32	0.25	32	64	64	0.5	1	8	8	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec17	131	ST131 Cplx	256	64	16	64	16	64	16	0.25	0.25	8	32	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec18	1650	ST131 Cplx	2	64	2	0.25	1	0.5	1	0.25	0.25	4	0.5	1	mcr-1
CR-Ec19	410	ST23 Cplx	2	256	128	0.25	0.5	1	0.5	0.25	0.5	4	0.5	0.25	mcr-1
CR-Ec20	1035	ST131 Cplx	128	64	2	64	16	64	32	0.5	0.5	4	16	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec21	1035	ST131 Cplx	64	32	1	16	64	128	128	0.25	0.25	4	8	0.25	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec22	1035	ST131 Cplx	128	128	4	32	32	64	64	0.25	0.25	4	8	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec23	1035	ST131 Cplx	64	32	1	16	128	128	64	0.25	0.25	4	16	0.25	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec24	1215	ST131 Cplx	8	128	2	16	16	32	32	0.5	1	8	0.25	0.5	blaCTX-M-1, mcr-1
CR-Ec25	131	ST131 Cplx	256	128	32	128	32	128	32	0.25	0.25	8	32	0.5	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec26	2279	ST131 Cplx	128	128	128	0.25	32	128	64	0.25	0.25	8	8	0.25	blaCTX-M-1, blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec27	1650	ST131 Cplx	8	64	1	0.25	0.25	1	0.25	0.25	0.5	4	0.25	0.25	mcr-1
CR-Ec28	88	ST23 Cplx	2	1	2	0.25	0.5	2	1	0.5	1	4	0.5	0.5	mcr-1
CR-Ec29	10	ST10 Cplx	128	64	32	0.25	0.5	1	0.5	0.25	0.25	4	0.5	0.25	mcr-1
CR-Ec30	23	ST23 Cplx	4	32	2	0.25	0.25	1	0.25	0.25	0.25	8	1	0.25	mcr-1
CR-Ec31	1215	ST131 Cplx	4	64	1	32	16	64	64	0.5	0.5	4	0.5	0.25	blaCTX-M-1, mcr-1
CR-Ec32	1215	ST131 Cplx	2	32	1	16	8	32	32	0.5	1	4	0.5	0.25	blaCTX-M-1, mcr-1
CR-Ec33	1035	ST131 Cplx	256	64	2	64	32	64	64	0.25	0.25	4	8	0.5	blaCTX-M-15, blaTEM, mcr-1
CR-Ec34	88	ST23 Cplx	4	2	2	0.25	0.5	1	1	0.25	0.5	4	1	0.5	mcr-1
CR-Ec35	3059	—	2	1	2	0.25	0.5	1	0.5	0.25	0.25	8	0.5	0.5	mcr-1

MCR-1, ESBLs, and clonal complex (CC).