Polymorphism of E6 and E7 Genes in Human Papillomavirus Types 31 and 33 in Northeast China

Table 4

Nucleotide sequence mutations of HPV33E6.

Category	Nucleotide position																	n (136)	Lineage
	14	18	96	105	106	109	165	207	217	247	256	279	338	372	413	426	441
Reference M12732.1	C	G	A	A	C	T	A	C	A	G	A	A	A	A	C	C	T		A
HPV33E601	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	95	A
HPV33E602	—	—	—	C	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12	A
HPV33E603	—	—	—	C	—	—	G	—	—	—	C	C	G	—	—	—	—	12	A
HPV33E604	T	—	—	C	—	—	G	—	—	—	C	C	G	—	—	—	—	1	A
HPV33E605	G	—	—	C	—	—	—	—	—	—	—	C	—	—	—	—	C	1	A
HPV33E606	—	—	—	C	—	—	—	—	—	—	C	—	—	T	—	—	—	5	A
HPV33E607	—	—	—	—	—	G	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	2	A
HPV33E608	—	—	—	C	—	G	G	—	—	—	C	C	G	—	—	—	—	1	A
HPV33E609	—	—	G	—	A	—	—	T	C	T	—	C	—	—	T	T	—	1	B
HPV33E610	—	—	—	C	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	C	2	A
HPV33E611	—	—	—	—	A	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1	A
HPV33E612	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	T	—	—	1	A
HPV33E613	—	—	—	C	—	—	—	—	—	—	—	C	—	—	—	—	C	1	A
HPV33E614	—	A	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1	A
aa mutation	Amino acid position
	5	6	32	35	36	37	55	69	73	83	86	93	113	124	138	142	147
Reference M12732.1	T	E	E	K	P	L	R	F	I	V	N	K	Q	R	A	S	T
	I/S	—	—	N	T	V	—	—	L	L	H	N	R	—	V	—	—
Protein secondary structure	C			C	C	C			H	E	H	C	H	C	C

indicates the positions of triallelic mutations.