Research Article
Predicting Cross-Species Infection of Swine Influenza Virus with Representation Learning of Amino Acid Features
Table 2
Amino acid set for predicting SIVs.
| Num | Pro1 | Pos2 | Entropy | Num | Pro | Pos | Entropy | Num | Pro | Pos | Entropy |
| 1 | HA | 9 | 1.57 | 13 | HA | 163 | 1.56 | 25 | HA | 401 | 1.51 | 2 | HA | 53 | 1.74 | 14 | HA | 169 | 1.65 | 26 | NA | 42 | 1.75 | 3 | HA | 78 | 1.56 | 15 | HA | 173 | 1.62 | 27 | NA | 43 | 1.78 | 4 | HA | 82 | 1.51 | 16 | HA | 189 | 2.17 | 28 | NA | 52 | 1.61 | 5 | HA | 131 | 1.59 | 17 | HA | 192 | 1.58 | 29 | NA | 93 | 1.77 | 6 | HA | 135 | 1.67 | 18 | HA | 193 | 1.63 | 30 | NA | 332 | 1.65 | 7 | HA | 137 | 1.57 | 19 | HA | 196 | 1.76 | 31 | NA | 344 | 1.55 | 8 | HA | 140 | 1.68 | 20 | HA | 199 | 1.62 | 32 | NA | 369 | 1.87 | 9 | HA | 142 | 1.90 | 21 | HA | 219 | 1.65 | 33 | NA | 385 | 1.74 | 10 | Ss | 144 | 2.15 | 22 | HA | 261 | 1.76 | 34 | NA | 400 | 1.72 | 11 | HA | 156 | 1.75 | 23 | HA | 269 | 1.54 | 35 | NA | 435 | 1.69 | 12 | HA | 159 | 1.65 | 24 | HA | 276 | 1.62 | 36 | PB1-F2 | 21 | 1.52 |
|
|
1Viral protein. 2Position of amino acid residue as H3 subtype numbering.
|