Research Article
Combining ZHENG Theory and High-Throughput Expression Data to Predict New Effects of Chinese Herbal Formulae
Table 2
The top 10 drug molecules affected pathways with Fuzheng Huayu Capsule or placebo.
| (a) Patient A |
| | cMap ID | Drug molecule | Dose | Pathway counts |
| | 169 | Tacrolimus | 1 uM | 22+ | | 383 | Cobalt chloride | 100 uM | 21+ | | 144 | Chlorpropamide | 100 uM | 20+ 1− | | 641 | Benserazide | 10 uM | 20+ | | 576 | Novobiocin | 100 uM | 20− | | 487 | Pirinixic acid | 100 uM | 20− | | 421 | Trifluoperazine | 10 uM | 20+ | | 314 | Exisulind | 50 uM | 20+ | | 284 | Tacrolimus | 1 uM | 20+ | | 268 | Genistein | 1 uM | 20+ |
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| (b) Patient B |
| | cMap ID | Drug molecule | Dose | Pathway counts |
| | 487 | Pirinixic acid | 100 uM | 53+ | | 161 | Verapamil | 10 uM | 52+ | | 2 | Metformin | 10 uM | 52+ | | 419 | Chlorpromazine | 10 uM | 49+ | | 49+ | Sirolimus | 100 nM | | | 49+ | Dexverapamil | 10 uM | | | 141 | Chlorpropamide | 100 uM | 49+ | | 122 | Alpha-estradiol | 10 nM | 49+ | | 457 | Tetraethylenepentamine | 100 uM | 47− | | 124 | Mesalazine | 100 uM | 46+ |
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| (c) Patient C |
| | cMap ID | Drug molecule | Dose | Pathway counts |
| | 608 | NU-1025 | 100 uM | 4− | | 418 | Haloperidol | 10 uM | 4+ | | 282 | Fludrocortisone | 1 uM | 4+ | | 1072 | Trichostatin A | 1 uM | 3+ | | 984 | Acetylsalicylic acid | 100 uM | 3+ | | 1009 | Clozapine | 10 uM | 3+ | | 1017 | Fluphenazine | 10 uM | 3+ | | 1024 | Haloperidol | 10 uM | 3+ | | 995 | Prochlorperazine | 10 uM | 3− | | 887 | Celastrol | 3 uM | 3+ |
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