Research Article
Similarity Network Fusion Based on Random Walk and Relative Entropy for Cancer Subtype Prediction of Multigenomic Data
Table 2
Comparison of
values between R
2SNF and other algorithms on seven cancer multigenomic datasets.
| | Cancer type | Methods | | R2SNF | SNF | LRAcluster | iClusterPlus | PFA | ANF | MCSM | RSNF |
| | GBM | 2.4E − 05 | 2.0E − 04 | 3.5E − 04 | 3.0E − 03 | 8.0E − 05 | 5.8E − 04 | 1.1E − 03 | 1.2E − 04 | | BIC | 1.1E − 04 | 1.1E − 03 | 4.3E − 02 | 3.5E − 02 | 9.3E − 03 | 3.6E − 04 | 3.1E − 05 | 1.2E − 04 | | KRCCC | 7.0E − 03 | 2.9E − 02 | 3.2E − 02 | 1.1E − 01 | 7.5E − 03 | 2.9E − 02 | 8.0E − 02 | 2.1E − 04 | | LSCC | 1.5E − 05 | 2.0E − 02 | 5.7E − 02 | 5.2E − 02 | 4.0E − 03 | 8.9E − 03 | 1.6E − 02 | 2.0E − 04 | | COAD | 1.8E − 03 | 1.3E − 03 | 9.9E − 03 | 5.0E − 02 | 6.7E − 02 | 9.0E − 03 | 3.6E − 01 | 6.0E − 03 | | BREAST | 4.5E − 09 | 1.0E − 08 | 3.0E − 01 | 1.5E − 01 | 3.6E − 07 | 1.9E − 08 | 7.4E − 07 | 2.3E − 08 | | LUNG | 5.6E − 03 | 1.1E − 02 | 4.6E − 01 | 6.9E − 01 | 2.0E − 01 | 1.0E − 02 | 8.0E − 02 | 8.2E − 02 |
|
|
The best results have been highlighted in bold.
|
