First Report and Genetic Characterization of Border Disease Virus in Sheep from Hulunbuir, Northeastern China
Table 1
Comparison of predicted border disease virus (BDV) polyprotein cleavage sites.
Virus
Cleavage site at
Npro/C
C/Erns
Erns/E1
E1/E2
E2/P7
P7/NS2
NS2/NS3
NS3/NS4A
NS4A/NS4B
NS4A/NS5A
TSC/SDD
VAP/ENV
ANA/QSP
AQG/QFA
TSA/INL
VKG/EGA
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Slashes (/) indicate cleavage. The BDV strains marked with different colors indicate different genotypes of BDV. BDV-1 (Orange), BDV-2 (Cyan), BDV-3 (Yellow), BDV-4 (Blue), BDV-5 (Brown), BDV-7 (Purple), BDV-8 (Green). BDV-6 was not listed in the table due to the need for a complete genome. OQ378958 marked with red color was the BDV strain identified in this study.
