Artificial Selection Drives SNPs of Olfactory Receptor Genes into Different Working Traits in Labrador Retrievers
Table 5
Genetic polymorphism and HWE analysis of the collective and working dog subpopulations.
Loci
Ho
He
PIC
HWE
Guide
Sniffer
Collective
Guide
Sniffer
Collective
Guide
Sniffer
Collective
Guide
Sniffer
Collective
OR0006:c.524 G > T
0.041
0.116
0.076
0.039
0.109
0.073
0.038
0.103
0.070
0.884
0.686
0.704
OR0007:c.331 T > C
0.245
0.581
0.402
0.214
0.413
0.321
0.191
0.328
0.270
0.329
0.007
0.016
OR0007:c.430 G > A
0.408
0.116
0.272
0.325
0.109
0.235
0.272
0.103
0.207
0.073
0.686
0.132
OR0007:c.508 G > A∗
0
0.186
0.087
0
0.169
0.082
0
0.154
0.079
—
0.501
0.663
OR0007:c.691 G > C
0.510
0.744
0.620
0.447
0.467
0.457
0.347
0.358
0.352
0.320
1E − 04
6E − 04
OR0007:c.730 T > C
0.245
0
0.130
0.225
0
0.122
0.191
0
0.114
0.329
—
0.503
OR0007:c.793 G > C
0.327
0.116
0.228
0.273
0.109
0.202
0.236
0.103
0.182
0.172
0.686
0.217
OR0007:c.829 C > T
0.918
0
0.957
0.497
0
0.499
0.373
0.375
0.375
3E − 09
5E − 11
1E − 18
OR0007:c.830 C > T
0.163
0
0.087
0.273
0
0.159
0.236
0
0.146
0.005
—
1E − 05
OR16C11:c.294 G > A∗
0.143
0.233
0.185
0.132
0.205
0.167
0.123
0.184
0.153
0.590
0.388
0.329
OR16C11:c.368 C > A
0
0.093
0.043
0
0.090
0.043
0
0.086
0.042
—
0.749
0.831
OR16C11:c.391 A > G
0.061
0
0.033
0.060
0
0.031
0.058
0
0.031
0.825
—
0.874
DOPRX09:c.479 G > A
1
1
1
0.5
0.5
0.5
0.375
0.375
0.375
3E − 12
5E − 11
9E − 22
DOPRX09:c.481 T > G
1
1
1
0.5
0.5
0.5
0.375
0.375
0.375
3E − 12
5E − 11
9E − 22
DOPRX09:c.486 T > G
0.918
0.605
0.772
0.497
0.422
0.474
0.373
0.333
0.362
3E − 09
0.004
2E − 09
DOPRX09:c.889 G > A∗
0.204
0
0.109
0.183
0
0.102
0.166
0
0.097
0.426
—
0.581
OR7215:c.251-C > T
0
0
0
0.273
0.472
0.466
0.236
0.360
0.358
3E − 12
5E − 11
9E − 22
OR7215:c.578-A > T
0
0
0
0
0.273
0.140
0
0.236
0.131
—
5E − 11
9E − 22
Asterisks marked out the breed-specific SNPs. No asterisks meant that the SNPs could be found in other dog breeds besides Labs. Observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), polymorphism information content (PIC), and Hardy–Weinberg equilibrium (HWE) values.
