[Retracted] Bioinformatic Analysis of PTTG Family and Prognosis and Immune Cell Infiltration in Gastric Cancer
Table 3
Correlation analysis between PTTGs and biomarkers of immune cells in TIMER.
Description
Gene markers
PTTG1
PTTG2
PTTG3P
None
Purity
None
Purity
None
Purity
Cor
Cor
Cor
Cor
Cor
Cor
CD8+T cell
CD8A
-0.036
-0.034
0.131
0.125
-0.016
-0.022
CD8B
0.019
0.031
0.107
0.111
0.026
0.021
T cell (general)
CD3D
-0.017
0.002
0.210
0.211
0.086
0.098
CD3E
-0.080
-0.065
0.145
0.138
-0.036
-0.032
CD2
-0.050
-0.042
0.213
0.209
0.091
0.101
B cell
CD19
-0.187
-0.185
0.125
0.097
-0.034
-0.035
CD79A
-0.216
-0.215
0.109
0.087
-0.037
-0.034
Monocyte
CD86
-0.036
-0.027
0.216
0.224
0.173
0.188
CD115(CSF1R)
-0.245
-0.251
0.156
0.152
0.029
0.034
TAM
CCL2
-0.174
-0.175
0.103
0.110
-0.017
-0.012
CD68
-0.093
-0.095
-0.013
-0.034
0.029
0.033
IL10
-0.095
-0.085
0.172
0.169
0.113
0.104
M1 macrophage
INOS (NOS2)
0.128
0.122
-0.005
-0.003
0.057
0.036
IRF5
-0.159
-0.162
-0.009
-0.020
-0.069
-0.072
COX2 (PTGS2)
-0.068
-0.066
0.102
0.114
0.093
0.111
M2 macrophage
CD163
-0.134
-0.137
0.201
0.206
0.108
0.125
VSIG4
-0.130
-0.140
0.174
0.179
0.103
0.111
MS4A4A
-0.182
-0.179
0.227
0.229
0.140
0.148
Neutrophils
CD66b (CEACAM8)
0.056
0.057
0.189
0.199
0.280
0.256
CD11b (ITGAM)
-0.217
-0.214
0.143
0.142
0.028
0.039
CCR7
-0.278
-0.273
0.181
0.180
-0.005
-0.004
Natural killer cell
KIR2DL1
0.066
0.074
0.209
0.219
0.223
0.201
KIR2DL3
0.047
0.054
0.296
0.302
0.323
0.301
KIR2DL4
0.250
0.269
0.148
0.140
0.178
0.177
KIR3DL1
0.013
-0.007
0.159
0.160
0.138
0.137
KIR3DL2
0.048
0.038
0.260
0.264
0.194
0.173
KIR3DL3
0.114
0.116
0.082
0.070
0.171
0.115
KIR2DS4
0.086
0.096
0.189
0.183
0.166
0.169
Dendritic cell
HLA-DPB1
-0.125
-0.113
0.168
0.165
0.019
0.025
HLA-DQB1
-0.035
-0.018
0.072
0.061
0.006
0.008
HLA-DRA
-0.034
-0.017
0.187
0.182
0.079
0.090
HLA-DPA1
-0.074
-0.060
0.166
0.160
0.052
0.057
BCDA-1 (CD1C)
-0.394
-0.403
0.185
0.176
0.000
0.000
BDCA-4 (NRP1)
-0.296
-0.291
0.193
0.205
0.015
0.029
CD11c (ITGAX)
-0.140
-0.125
0.182
0.181
0.117
0.122
Th1
T-bet (TBX21)
-0.033
-0.034
0.136
0.121
0.026
0.013
STAT4
-0.172
-0.165
0.286
0.300
0.134
0.142
STAT1
0.245
0.244
0.133
0.121
0.127
0.118
IFN-Îł (IFNG)
0.273
0.281
0.171
0.160
0.174
0.179
TNF-α (TNF)
0.026
0.036
0.006
-0.017
0.026
0.039
Th2
GATA3
-0.171
-0.160
0.180
0.188
-0.004
-0.007
STAT6
-0.206
-0.213
0.014
0.012
-0.140
-0.139
STAT5A
-0.201
-0.205
0.170
0.154
-0.042
-0.042
IL13
-0.003
-0.005
0.031
0.019
-0.041
-0.053
Tfh
BCL6
-0.371
-0.370
0.157
0.163
-0.027
-0.012
IL21
0.121
0.142
0.193
0.174
0.160
0.172
Th17
STAT3
-0.231
-0.237
0.114
0.104
-0.040
-0.035
IL17A
0.171
0.175
-0.085
-0.112
0.051
0.056
Treg
FOXP3
0.012
0.022
0.035
0.017
-0.035
-0.047
CCR8
-0.077
-0.080
0.182
0.176
0.124
0.125
STAT5B
-0.362
-0.364
0.156
0.159
-0.072
-0.072
TGFβ (TGFB1)
-0.206
-0.192
0.042
0.042
-0.106
-0.104
T cell exhaustion
PD-1 (PDCD1)
0.061
0.072
0.058
0.042
-0.057
-0.069
CTLA4
0.110
0.124
0.184
0.177
0.138
0.147
LAG3
0.146
0.152
0.095
0.081
0.013
-0.001
TIM-3 (HAVCR2)
-0.004
0.004
0.182
0.181
0.157
0.158
GZMB
0.305
0.322
0.121
0.105
0.146
0.147
TAM: tumor-associated macrophage; Th: T helper cell; Tfh: follicular helper T cell; Treg: regulatory T cell. value of Spearman’s correlation coefficient; correlation with no modification; correlation after using the purity criterion. ;;.